Istnieje szereg sytuacji, kiedy wniosek o zwrot sumy podatku nie zostanie przekazany do właściwego państwa członkowskiego. Poniżej zostały wymienione wszystkie te okoliczności.

Wniosek o zwrot opodatkowania od towarów i usług nie zostanie przekazany do  właściwego państwa członkowskiego, w przypadku, gdy w czasokresie do którego odnosi się wniosek płatnik, nie jest płatnikiem w rozumieniu artykułu 15 ustawy o podatku od towarów i usług. Płatnik dokonał wyłącznie dostawy produktów lub świadczenia usług zwolnionych od opodatkowania innych niż transakcje zwolnione, w odniesieniu, do których przysługuje odliczenie opodatkowania naliczonego lub był zwolniony od podatku na podstawie zwolnienia podmiotowego.

W powyższych sytuacjach naczelnik urzędu skarbowego wydaje postanowienie o nie przekazywaniu wniosku do właściwego państwa członkowskiego.  Płatnik, który nie zgadza się z tą orzeczeniem może złożyć zażalenie od decyzji postanawiającej wydanej przez naczelnika urzędu skarbowego. Ponadto należy wziąć pod uwagę fakt, iż decyzja postanawiająca o nie przekazaniu wniosku do właściwego państwa członkowskiego zwrotu nadejdzie drogą elektroniczną, w taki sam sposób i na taki sam adres e mali, z którego ten wniosek wypłynął.

Wielu płatników zastanawia się co musiałoby nastąpić, by kwota zabezpieczenia nie została uwolniona? Odpowiedź na to pytanie znajduje się w poniższym tekście i służy pomocą wszystkim zainteresowanym tą kwestią.

Zwolnienia zabezpieczenia nie dokonuje się w przypadku wszczęcia postępowania skarbowego w zakresie rozliczenia, którego dotyczy gwarancja, do czasu zakończenia tego postępowania lub kontroli skarbowej w zakresie rozliczenia, którego dotyczy zabezpieczenie, do upływu terminu 3 miesięcy od dnia zamknięcia kontroli, jeżeli w tym terminie nie wszczęto kontroli podatkowej.

W przypadku wszczęcia postępowania sprawdzającego zgodnie z przepisami  o kontroli skarbowej w zakresie rozliczenia, którego dotyczy zabezpieczenie,  uchroniona kwota uwalniania jest dopiero po zakończeniu postępowania. Nie ma możliwości wcześniejszego zwolnienia zabezpieczenia.

Natomiast w przypadku stwierdzenia, że płatnik w złożonej deklaracji podatkowej wykazał sumę zwrotu różnicy podatku lub zwrotu podatku naliczonego nienależną lub wyższą od kwoty należnej i otrzymała ją gwarancja nie jest zwalniana do czasu uregulowania zaległości podatkowej.

Naczelnikowi urzędu skarbowego przysługuje prawo do odmowy przyjęcia zabezpieczenia. Od jego decyzji zależy także, kiedy złożone zabezpieczenie zostanie uwolnione. Bliższe informacje na ten temat znajdują się w poniższym tekście i służą pomocą wszystkim zainteresowanym.
Naczelnik urzędu skarbowego ma prawo do odmowy przyjmowania złożonego zabezpieczenia, jeśli zaobserwuje, ze złożone zabezpieczenie nie zapewnia pokrycia w całości wypłacanej sumy zwrotu lub gdy złożona gwarancja nie zapewni w sposób pełny pokrycia w terminie wypłaconego zwrotu, w przypadku zabezpieczenia z określonym terminem ważności.
Zabezpieczenie majątkowe zostaje oddane w dniu następującym po dniu zakończenia przez organ skarbowy weryfikacji, której był poddawany wniosek o zwrot podatku lub w dniu, w którym upłynęło 180 dni od dnia złożenia deklaracji podatkowej, w której była wykazana kwota zwrotu.
Powyższy stan prawny wynika z artykułu 87 ustęp 4d i 4f ustawy o podatku od towarów i usług, zwanej tez ustawą VAT-owską. Ustawa ta została znowelizowana i weszła w życie z dniem 7 listopada 2008 roku. Obowiązuję , z małymi zmianami do dnia dzisiejszego.